通常情况下，TopFlow升级时只会升级系统文件，不会覆盖用户的自定义文件，但以下文件及目录应经常备份：

• \TopFlow.Config -- 用户的配置文件

• \Web.Config -- 系统配置文件

• \Forms\ -- 用户自定义表单所在目录

• \WorkFlows\ -- 用户自定义流程所在目录

• \Listviews\ -- 用户自定义报表所在目录

• \Reports\ -- 用户自定义个性化报表所在目录

• \Charts\ -- 用户自定义图形报表所在位置

• \WebParts\ -- 门户构件所在目录（如果有添加自定义门户页面，则应备份）

• \Modules\ -- 扩展模块所在目录（如果有使用扩展模块，则应备份，如TopFlow.Doc）

除此之外，数据库应定时做完整备份，以备不时之需。